在过去的12个月中,Interactive Scientific与爱丁堡大学的一组科学家一起开展了一个合作项目,以利用Interactive Scientific开发虚拟现实原型软件,以彻底改变药物设计的可视化效果。’的技术,Nano Simbox。

药物设计过程

整体R&制药和生物技术领域的D支出在不断增长USD 128 billion in 2008 to USD 158 billion in 2017*, to cope with the sheer complexity of the drug discovery process.

计算化学家目前使用基于结构的药物设计(SBDD),利用蛋白质的静态三维结构来辅助药物发现过程。基于集成的药物设计(EBDD)是SBDD的新兴替代产品,它利用了蛋白质的柔性特性并利用了蛋白质的动态结构整体表示。

作为由欧洲研究委员会资助的活动的一部分,由爱丁堡的朱利安·米歇尔(Julien Michel)博士领导的团队开发了新的EBDD软件,通过结合实验和分子模拟来生成这种结构体。

但是,目前尚无有效的方法让研究人员与蛋白质结构的多种稳定构象的表达进行交互。这个新项目探索了基于虚拟现实的用户界面(VRUI)的开发,从而提供了前所未有的可能性,并创建了新颖的可视化方法,对分子模拟进行操作并从中获得洞察力,以探索这些不同的蛋白质结构。

爱丁堡大学的计算化学家开发了后端分子模拟软件,而Interactive Scientific创建了前端视觉实现以开发新方法。这项合作由欧洲研究理事会概念验证资助资助,并得到爱丁堡创新公司的支持,该公司管理着爱丁堡大学的行业参与。

Interactive Scientific之前曾与布里斯托大学合作,后者在 科学进步,强调他们的研究也使用了Nano Simbox。这项研究表明,VR在完成复杂分子任务方面的效率是传统方法的10倍。

虚拟现实带来更好的可视化

所开发的概念证明可深入了解VRUI,该VRUI可以有效地可视化分子动力学轨迹集。原型软件已用于探索一组治疗相关蛋白质上不同复杂性的分子运动。

项目摘要,标题为“基于集成的药物设计的虚拟现实界面 ”将由爱丁堡大学的Jordi Juarez-Jimenez博士讲授’6年级的化学学院 CCPBioSim年度会议:药物发现和开发中的分子模拟;展示于2018年9月5日至7日在牛津大学举行的生物分子模拟方法和应用的展示。

Interactive Scientific的CTO Phill Tew评论“该模型是与爱丁堡大学合作开发的,具有改变我们与药物发现中分子相互作用和可视化方式的潜力。我们’对继续开发CADD感到兴奋&与大学和行业合作者一起使用的EBDD工具。”

预计将分子动力学信息整合到药物设计流程中的新一代软件将减少在药物开发过程中花费的时间和金钱。 Interactive Scientific将于2018年秋季启动其研发软件,有关更多详细信息,请访问interactscientific.com。